Calcul scientifique

L'IGBMC dispose d'une ferme de calcul accessible à l'ensemble des équipes de recherche et plate-formes de l'IGBMC.

Pré-requis

Pour accéder à la ferme de calcul vous devez disposer d'un compte informatique actif ainsi que d'un client SSH.

Windows

Utilisez le logiciel gratuit Putty pour accéder à la ferme de calcul.

Mac

Utilisez l'application Terminal disponible dans le menu Applications > Utilitaires.

Linux

Utilisez le terminal ou la console disponible dans votre environnement.

Se connecter à la ferme de calcul

La ferme de calcul de l'IGBMC est accessible au travers de l'hôte hpc.igbmc.fr.

Pour vous connecter à la ferme de calcul, ouvrez une session sur hpc.igbmc.fr à l'aide de votre identifiant et mot de passe IGBMC.

Windows

Lancez Putty et indiquez hpc.igbmc.fr dans le champ Host Name

Puis cliquez sur Open
Votre identifiant et mot de passe vous alors seront demandés.

Mac et Linux

Ouvrez un terminal et lancez la commande ssh :

$ ssh <login>@hpc.igbmc.fr

Accéder à ses données

Plusieurs volumes de stockage de données sont à votre disposition sur la ferme de calcul de l'IGBMC. L'ensemble de ces volumes sont accessible à partir du dossier /shared.

Vous disposez d'un répertoire personnel (homedir) spécifique à la ferme de calcul de l'IGBMC. Cet espace est situé dans le dossier /shared/home/<votre_login>.

Vous pourrez retrouver la zone labo de votre équipe dans le dossier /shared/labo4

Les espaces de stockage à la demande sont accessibles depuis les dossiers /shared/labo5, /shared/labo6 et /shared/labo7.

Si vous ne parvenez pas à retrouver un espace de stockage particulier, merci de contacter le support en envoyant un mail à helpdesk@igbmc.fr.

Aller plus loin

Calculs sur processeurs standards

Noeuds standards 32
Cœurs physiques 420
Cœurs maximum par noeud 64
Mémoire vive (RAM) 2,5 To
Mémoire vive maximum par noeud 256Go

Calculs sur processeurs graphiques

Noeuds GPU 1
Processeurs GPU 4 (Tesla K80)
Cœurs Cuda 19968
Mémoire vive (RAM) 128 Go

Stockage performant et partagé

La ferme de calcul dispose d'un volume de stockage performant de 70To pour accueillir vos données à traiter.